福建医科大学创建于1937年，其前身是福建省立医学专科校园。1939年改名为福建省立医学院。1949年改称福建医学院。1969年，与福建中医学院、华侨大学医疗系兼并，建立福建医科大学。1982年更名为福建医学院。1996年4月改为现名。

  通过70多年的建造开展，校园已构成学士—硕士—博士人才教育训练系统和“勤勉、谨慎、务实、立异”优异校风，成为一所集教育、科研、医疗、防备和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，被福建省人民政府确认为要点建造高校。同年以杰出的效果通过了教育部本科教育工作水平评价。

  校园现有上街、台江2个校区，占地1300余亩，校舍建筑面积37.9万平方米。校园屡次被评为福建省党建和思想政治工作先进高校、省文明校园、省“依法治校”示范校、省“校务揭露”示范校、省方案生育先进单位、省卫生先进单位、省美化榜样单位和省级花园式单位等。2008年9月，校园被颁发“全国教育系统抗震救灾先进集体”荣誉称号。

  校园现有19个学院、部，即根底医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、口腔医学院、医学技能与工程学院、人文学院、研究生学院、海外教育学院、成人教育学院、工作技能学院、持续教育学院、榜首临床医学院、第二临床医学院、协和临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、海峡学院、和体育教研部；23个本科专业（方向），即临床医学（本硕连读）、临床医学、临床医学（临床病理学专业方向）、临床医学（急救医学专业方向）、口腔医学、医学查验、麻醉学、医学影像学、临床医学(眼与视光学专业方向)、恢复治疗学、防备医学、防备医学(查验检疫专业方向)、防备医学(妇幼保健专业方向)、护理学、药学、药学(临床药学专业方向)、药学(药物剖析专业方向)、药物制剂、应用心理学、英语、社会工作、公共事业办理(卫生办理专业方向)、公共事业办理(医院办理专业方向)；博士学位授权点22个，硕士学位授权点59个、专业硕士学位授权点2个。现在，各类在校生20000多人，其间本科生10000多人，博士、硕士生近2000人，本科专业对全国20个省、直辖市、自治区和港澳台地区招生。

  校园现有教职医护职工5398人，其间校本部966人。在835名专任教师中，具有研究生学位占58%，高档职称占55.1%。博士生导师65名，硕士生导师482名。享用国务院特殊津贴专家100人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选5人，国家有突出贡献中青年专家4人，卫生部有突出贡献中青年专家3人，教育部优异青年教师赞助3人，教育部骨干教师赞助8人，福建省优异专家17人，“福建省百千万人才工程”人选64人，福建省高校教育名师4人，福建省高校新世纪优异人才支撑方案人选28人，福建省高校立异团队2个。

  校园有隶属医院(含临床医学院)10所，其间9所综合性隶属医院(含临床医学院) 均为三级甲等医院，即隶属榜首医院、隶属第二医院、隶属协和医院、省立临床医学院（省立医院）、福总临床医学院（福州总医院）、隶属厦门榜首医院隶属漳州市医院、隶属泉州榜首医院和隶属三明榜首医院；隶属口腔医院1 所。此外，有临床教育医院26所，构成了比较完善的临床教育与实践教育基地网络。

  现在，校园有临床医学博士后科研流动站1个，科研机构65个，福建省“211”工程要点学科2个，省要点学科13个，省科技厅优先开展学科8个，校园要点学科6个，省医学要点专科6个，省抢先医疗特征专业5个，省高校要点实验室3个，承担着很多的科研任务，效果明显。校园编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管恢复医学杂志》等，面向国内外揭露发行。校园图书馆面积25233平方米，图书、材料153万册，是福建省医学图书中心馆。

  “十一五”期间，我校将以党的精力为辅导，推动校园新一轮开展，成为办学规划适度，学科结构契合常理，办学层次较高，整体实力较强；以普通本科教育为主，加速开展研究生教育和长学制医学教育；以医学为主，理学、办理学、法学等多学科协调开展的教育研究型省属要点医科大学，成为海峡西岸高档医药卫生人才首要培育基地、医学科学研究中心和医疗防备保健中心，跨入国内同类高校的先进队伍。